Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrcpO35427 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrcpO35427 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrcpO35427 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CrcpO35427 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrcpO35427 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CrcpO35427 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CrcpO35427 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CrcpO35427 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms