Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xbp1O35426 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xbp1O35426 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms