Protein–RNA interactions for Protein: O35417

Pdyn, Proenkephalin-B, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdynO35417 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdynO35417 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdynO35417 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdynO35417 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdynO35417 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PdynO35417 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdynO35417 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdynO35417 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdynO35417 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdynO35417 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdynO35417 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdynO35417 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdynO35417 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdynO35417 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdynO35417 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdynO35417 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdynO35417 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdynO35417 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdynO35417 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdynO35417 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdynO35417 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdynO35417 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdynO35417 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdynO35417 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdynO35417 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdynO35417 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdynO35417 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdynO35417 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdynO35417 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PdynO35417 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdynO35417 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdynO35417 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdynO35417 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdynO35417 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdynO35417 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms