Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf11aO35305 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfrsf11aO35305 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf11aO35305 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms