Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Pkd2O35245 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31,65■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31,65■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Pkd2O35245 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,65
Pkd2O35245 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Pkd2O35245 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Pkd2O35245 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,4 ms