Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad6O35182 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad6O35182 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad6O35182 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad6O35182 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad6O35182 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad6O35182 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad6O35182 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad6O35182 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms