Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Polr1aO35134 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Polr1aO35134 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Polr1aO35134 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Polr1aO35134 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms