Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tcof1O08784 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcof1O08784 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms