Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5849J3QPE5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5849J3QPE5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms