Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c2J3QNM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms