Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16427J3QN52 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm16427J3QN52 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16427J3QN52 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16427J3QN52 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms