Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21972J3QN38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms