Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms