Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
AK157302I3ITR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
AK157302I3ITR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms