Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arfip1G5E8V9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip1G5E8V9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip1G5E8V9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms