Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3tc1G3X9F6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3tc1G3X9F6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms