Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4cG3UXD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Speer4cG3UXD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer4cG3UXD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.1 ms