Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M1F7CXU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M1F7CXU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M1F7CXU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms