Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl9F7BE40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl9F7BE40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl9F7BE40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms