Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngap1F6SEU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms