Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm340F6RGI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms