Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmod3E9QA62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmod3E9QA62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms