Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930451I11RikE9Q9R3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4930451I11RikE9Q9R3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms