Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mcmdc2E9Q956 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mcmdc2E9Q956 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mcmdc2E9Q956 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mcmdc2E9Q956 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mcmdc2E9Q956 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcmdc2E9Q956 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms