Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BC005561E9Q5E2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BC005561E9Q5E2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BC005561E9Q5E2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
BC005561E9Q5E2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms