Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpfE9Q3P4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CenpfE9Q3P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpfE9Q3P4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpfE9Q3P4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms