Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r88E9Q235 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r88E9Q235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r88E9Q235 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms