Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zfp558E9Q1J0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Zfp558E9Q1J0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Zfp558E9Q1J0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp558E9Q1J0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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