Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdr1E9Q0B4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr1E9Q0B4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms