Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3002E9PW72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3002E9PW72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3002E9PW72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3002E9PW72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms