Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30bE9PVL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30bE9PVL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms