Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgaE9PV24 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgaE9PV24 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FgaE9PV24 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FgaE9PV24 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgaE9PV24 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgaE9PV24 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms