Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21560D3Z7A4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21560D3Z7A4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21560D3Z7A4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21560D3Z7A4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms