Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms