Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
5430403G16RikD3Z5L4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
5430403G16RikD3Z5L4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
5430403G16RikD3Z5L4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms