Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc170D3YXL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc170D3YXL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms