Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC048679D3YXE9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BC048679D3YXE9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms