Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia4B8QI36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia4B8QI36 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia4B8QI36 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms