Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Zfp563B8JJZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp563B8JJZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Zfp563B8JJZ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp563B8JJZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Zfp563B8JJZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp563B8JJZ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Zfp563B8JJZ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp563B8JJZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp563B8JJZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp563B8JJZ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp563B8JJZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp563B8JJZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Zfp563B8JJZ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Zfp563B8JJZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp563B8JJZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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