Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb5B5X0E4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb5B5X0E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms