Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cped1B2RX70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cped1B2RX70 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms