Protein–RNA interactions for Protein: B2RWK3

Gm9992, Predicted gene 9992, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9992B2RWK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm9992B2RWK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm9992B2RWK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm9992B2RWK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm9992B2RWK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms