Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700018F24RikB2RW27 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700018F24RikB2RW27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700018F24RikB2RW27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms