Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rd3lB2RV38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rd3lB2RV38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.6 ms