Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7aB2RT54 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7aB2RT54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7aB2RT54 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms