Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfc3h1B2RT41 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfc3h1B2RT41 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfc3h1B2RT41 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfc3h1B2RT41 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms