Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a6B1AVK5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col4a6B1AVK5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a6B1AVK5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms