Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NhsB1AV60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NhsB1AV60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NhsB1AV60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms