Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700084M14RikB1AT01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700084M14RikB1AT01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700084M14RikB1AT01 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms