Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Proca1B0QZF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Proca1B0QZF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms